ประวัติความเป็นมา

วันที่ 11 พฤศจิกายน พ.ศ.2541 คณะอิสลามศึกษา วิทยาลัยอิสลามยะลา ได้เปิดรับนักศึกษารุ่นแรกในสาขาวิชาชะรีอะฮฺและสาขาวิชาอุศูลุดดีน สาขาละ 100 คน รวม 200 คน 

วันที่ 1 มิถุนายน พ.ศ.2544 คณะอิสลามศึกษา วิทยาลัยอิสลามยะลาได้รับอนุมัติให้เปิดหลักสูตรประกาศนียบัตรบัณฑิต สาขาวิชาการสอนอิสลามศึกษา จากทบวงมหาวิทยาลัย โดยมีนักศึกษารุ่นแรก 49 คน

คณะอิสลามศึกษาได้รับการรับรองมาตรฐานการศึกษาในระดับอุดมศึกษาจากทบวงมหาวิทยาลัย สาขาวิชาชะรีอะฮฺตามหนังสือรับรองที่ 53/2544 และสาขาวิชาอุศูลุดดีนตามหนังสือรับรองเลขที่ 54/2544 

วันที่ 1 พฤษภาคม พ.ศ. 2545 ทบวงมหาวิทยาลัยได้ให้ความเห็นชอบเปิดดำเนินการหลักสูตรศิลปศาสตรบัณฑิตสาขาวิชาภาษาอาหรับ

วันที่ 20 กุมภาพันธ์ พ.ศ. 2548 สภาวิทยาลัยอิสลามยะลาได้ให้ความเห็นชอบเปิดหลักสูตรศิลปศาสตร มหาบัณฑิตสาขาวิชาชะรีอะฮฺ และสาขาวิชาประวัติศาสตร์และอารยธรรมอิสลาม 

วันที่ 8 สิงหาคม พ.ศ. 2548 สาขาวิชาชะรีอะฮฺและอุศูลุดดีนได้รับการรับรองและกำหนดคุณสมบัติเฉพาะสำหรับตำแหน่งข้าราชการครูและบุคลากรทางการศึกษา  สังกัดกระทรวงศึกษาธิการจากสำนักงาน ก.ค.ศ. ตามหนังสือเลขที่  ศธ 0206.2/1152 ลงวันที่ 9 สิงหาคม พ.ศ. 2548 และ ศธ 0206.2/1152 ลงวันที่ 9 สิงหาคม พ.ศ. 2548  ตามลำดับ

วันที่ 28 ตุลาคม พ.ศ. 2549 คณะกรรมการการอุดมศึกษาให้การรับรองหลักสูตรศิลปศาสตมหาบัณฑิตสาขาวิชาชะรีอะฮฺ

วันที่ 21 กันยายน พ.ศ. 2552 คณะกรรมการการอุดมศึกษาให้การรับรองหลักสูตรศิลปศาสตมหาบัณฑิตสาขาวิชาประวัติศาสตร์และอารยธรรมอิสลาม

วันที่ 15 พฤษภาคม พ.ศ. 2550  สภามหาวิทยาลัย ได้รับทราบและเห็นชอบให้คณะอิสลามศึกษาและนิติศาสตร์ มหาวิทยาลัยฟาฏอนีเปิดหลักสูตรศิลปศาสตรบัณฑิตสาขาวิชาอิสลามศึกษา ต่อมา เมื่อวันที่ 14  กุมภาพันธ์  พ.ศ. 2554 สำนักงานคณะกรรมการการอุดมศึกษา ได้รับรองมาตรฐานหลักสูตรดังกล่าว

ในปี พ.ศ. 2555 คณะอิสลามศึกษาได้เปลี่ยนชื่อคณะเป็น คณะอิสลามศึกษาและนิติศาสตร์ เพื่อให้สอดคล้องกับหลักสูตรนิติศาสตรบัณฑิตสาขาวิชานิติศาสตร์

วันที่ 24 พฤศจิกายน พ.ศ. 2556 สภามหาวิทยาลัยฟาฏอนีได้ให้ความเห็นชอบเปิดหลักสูตรนิติศาสตรบัณฑิตสาขาวิชานิติศาสตร์

วันที่ 25 พฤศจิกายน พ.ศ. 2556 สภามหาวิทยาลัยฟาฏอนีได้ให้ความเห็นชอบเปิด หลักสูตรศิลปศาสตรมหาบัณฑิตสาขาวิชาอิสลามศึกษา

วันที่ 7 กรกฎาคม พ.ศ. 2558  สำนักงานคณะกรรมการการอุดมศึกษา ได้รับทราบและเห็นชอบให้คณะอิสลามศึกษาและนิติศาสตร์ มหาวิทยาลัยฟาฏอนีเปิดหลักสูตรปรัชญาดุษฎีบัณฑิต สาขาวิชาอิสลามศึกษา เพื่อเปิดรับนักศึกษาในปีการศึกษา 2558

วันที่ 25 มีนาคม พ.ศ. 2560 สภามหาวิทยาลัยฟาฏอนีได้อนุมัติ/ให้ความเห็นชอบหลักสูตรศิลปศาสตรบัณฑิตสาขาวิชาอัลกุรอานและอัสสุนนะฮฺ (หลักสูตรนานาชาติ) และได้เริ่มใช้หลักสูตร ภาคการศึกษาที่ 1 ปีการศึกษา 2561

วันที่ 6 กันยายน พ.ศ. 2568 สภามหาวิทยาลัยฟาฏอนีได้อนุมัติ/ให้ความเห็นชอบหลักสูตรศิลปศาสตรบัณฑิตสาขาวิชาอุศูลุดดีนและดะอฺวะฮฺ (หลักสูตรนานาชาติ)และได้เริ่มใช้หลักสูตร ภาคการศึกษาที่ 1 ปีการศึกษา 2569